Космический линкор Ямато

Империя Гамилус под руководством Лорда Деслера начинает вторжение на Землю в 2199 году. Поскольку родная атмосфера Гамилус содержит радиацию, они обстреливают планету радиоактивными астероидами. Поверхность Земли становится непригодной для жизни, человечество вынуждено уйти в подземные города. Однако радиация проникает и в эти убежища, угрожая полным уничтожением людей. Военная мощь землян недостаточна для сопротивления, и у выживших не остаётся эффективных средств борьбы с захватчиками.

На Марсе терпит крушение космический корабль неизвестной цивилизации. Сусуму Кодай и Дайсукэ Сима находят на его борту тело погибшей девушки и послание от правительницы планеты Искандер. В послании предлагается помощь в борьбе с угрозой: на Искандере существует устройство, способное очистить Землю от радиации. Также прилагается инструкция для создания мощного космического двигателя. Кодай и Сима находят затонувший во время Второй мировой войны корабль «Ямато», модифицируют его и отправляются в путь под командованием капитана Дзюдзо Окиты. Путешествие к Искандеру займёт год. Если экипаж не успеет, человечество погибнет.