Записная книжка Бога

Наруми Фудзисима — школьник, который часто переезжает и не проявляет интереса к общению с одноклассниками. Его неприметность и отсутствие желания сходиться с людьми приводят к тому, что он держится особняком в классе. После очередного переезда Наруми сталкивается с Аякой Синодзаки — своей одноклассницей, которая ведет себя энергично и импульсивно. Она уговаривает его вступить в школьный кружок садоводства. Затем Аяка приглашает Наруми отметить это событие на её рабочем месте. С этого момента начинается знакомство с обстоятельствами, которые изменят его повседневную жизнь.

На работе Аяки Наруми знакомится с её нанимательницей — девочкой по имени Алиса в возрасте около 10-12 лет. Алиса физически слаба и практически не встает с кровати. Её комната заполнена плюшевыми игрушками и множеством мониторов. Несмотря на своё состояние, Алиса занимается расследованием тайн и решением проблем, которые возникают в городе и за его пределами. Наруми оказывается вовлечен в эту деятельность, и теперь ему предстоит помогать Алисе в её расследованиях, сталкиваясь с различными загадками и задачами.