Кайто Даимон, старшеклассник, известен способностью быстро решать сложные головоломки. Эта особенность привлекла внимание организации «POG». Кайто предложили пройти специальный тест, и он заподозрил подвох, но оказался заперт в смертельном лабиринте под названием Головоломка Философа. Лабиринт был заполнен ловушками-загадками, любая ошибка в которых приводила к гибели. Кайто удалось выбраться из лабиринта, используя свои интеллектуальные способности, и также спасти свою подругу детства Ноноху

Браслет Орфея был сломан, и жизнь главных героев перешла в спокойную фазу. Однако не все персонажи приняли установившийся порядок. Возникает организация под названием Орден Орфея, которая считает Даймона (Кайто) ренегатом и предателем. В результате Орден Орфея начинает охоту на Даймона. Цель организации - устранить персонажа, которого они считают нарушителем установленных правил. Организация предпринимает вторжение в школу Квадратного Корня. Это событие заставляет бывших противников Даймона